免疫預防要根據疫病監測情況、疫病流行的規律，結合當地的動物疫情和疫苗的性質與作用，制定科學合理的、符合本場實際的免疫程序，有計劃的實施免疫接種。不要盲目的使用疫苗，不要把疫苗接種看成是的。疫苗接種的種類過度、接種的次數頻繁、超大劑量的長期使用疫苗接種，都有可能造成豬體產生免疫麻痹或免疫不全，疫苗相互之間產生干擾，而導致免疫失敗。
疫苗接種參考程序
1、豬瘟的免疫
 豬瘟脾淋活疫苗（兔源）
仔豬：23—28日齡首免，每頭肌注1頭份；65—70日齡2免，每頭2頭份。
后備種豬：發情配種*天加強免疫1次，每頭2頭份。
生產母豬：產仔后10天加強免疫1次，每頭2頭份。
種公豬：每年春秋各免疫1次，每次每頭肌注2頭份。妊娠期間不接種豬瘟弱毒疫苗。
由于大耳白兔滿足不了脾淋疫苗生產的需要，少數廠家在豬瘟脾淋苗中摻入污染粘膜病毒的細胞苗，2009年中國獸藥監察所用ELISA方法檢查22批豬瘟脾淋苗，發現其中有5批摻入了污染的弱毒細胞苗。
2、豬瘟弱毒活疫苗（牛睪丸細胞苗）
免疫程序與豬瘟脾淋苗相同。
我國牛群感染粘膜病病毒（BVDV）幾乎達100%，很少檢出陰性牛群。使用牛睪丸細胞生產豬瘟疫苗，非常容易造成BVDV污染，用污染的細胞苗給豬接種，不僅能干擾豬瘟疫苗抗體的產生，造成免疫失敗；而且BVDV還可引起母豬發生繁殖障礙，病毒通過胎盤傳給仔豬，引起仔豬發病，發病率高達50%，其臨床癥狀和病理變化與豬瘟十分相似，鑒別檢測非常困難。2009年中國獸藥監察所用PCR方法對23個批次的豬瘟牛睪丸細胞苗進行了檢測，發現有5批疫苗污染有BVDV，污染率為21.74%。許多豬場使用豬瘟細胞苗免疫豬只后，仍然發生豬瘟，造成重大的經濟損失。
3、ST豬瘟傳代細胞活疫苗
免疫程序與豬瘟脾淋苗相同，其特點是病毒滴度高，生產工藝穩定，質量易控制；批間差異??；免疫效力高；安全、效果確切；無外源病毒污染，減少了其他病毒混合感染的干擾作用。
4、藍耳病的免疫
 藍耳病弱毒活疫苗
 仔豬：14日齡首免，每頭肌注1頭份；2周后2免，每頭1頭份。
 后備種豬：*次發情前3周加強免疫1次，每頭肌注2頭份。
 生產種豬：每四個月免疫1次，每次于配種前15天免疫，每頭肌注2頭份。妊娠母豬不準接種藍耳病弱毒活苗。
 藍耳病滅活疫苗
 保護力低、產生抗體時間長，免疫效果不佳，盡可能不使用。
 免疫時注意：藍耳病弱毒活疫苗能干擾豬瘟疫苗產生抗體，影響豬瘟疫苗的免疫效果。兩個活疫苗不能同時接種，應間隔5-7天分別接種，即可避免其干擾作用。同時蘭耳病弱毒疫苗又受圓環病毒的干擾，當豬群中存在隱性感染圓環病毒時，接種蘭耳病弱毒疫苗，其免疫效果也受到影響。
5、豬偽狂犬病的免疫
偽狂犬病雙基因缺失活疫苗：
仔豬：出生后2日齡滴鼻免疫，每個鼻孔滴0.5毫升。35日齡加強免疫1次，每頭肌注1頭份。